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花生种子的主要结构有种皮、胚茎、和胚乳三个结构。种皮由表皮细胞的特化等组合原因而形成；胚茎属于茎部，功能和茎部相似，指的就是花生根部与茎部的连接处；种子萌发后，胚茎向上伸长，将子叶推出地面，因此花生芽出土主要依赖于胚茎伸长。
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